某些有害的物質***如：農藥、化肥使用;工業廢水;生活汙水;醫院汙水等***進入水體，超過其自淨能力，引起天然水體的物理上、化學上的變化。 水源汙染主要有兩種形式：
一是自然汙染：因地質的溶解作用，降水對大氣的淋洗、對地面的沖刷，挾帶各種汙染物流入水體而形成;
二是人為的汙染，即工業廢水、生活汙水、農藥化肥等對水體的汙染。
後一種是比較嚴重的，但也是可以控制的。
水源的汙染源主要有七種：即病原體汙染、需氧物質汙染、植物性營養物汙染、熱汙染、放射性汙染、鹽汙染和有機物與重金屬汙染等。